Τρίτη 30 Αυγούστου 2016

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΤΗ ΜΕΤΑΓΡΑΦΗ



Δίνεται ένα γονίδιο προκαρυωτικού κυττάρου σε σχέση με τις αλληλουχίες λήξης της μεταγραφής του:

CGAAACGTTTC CCGATCAATGTACAATTGACATGTAATTAACAC          αλυσίδα Α
GCTTTGCAAAG GGCTAGTTACATGTTAACTGTACATTAATT GTG          αλυσίδα Β

Οι αλληλουχίες λήξης της μεταγραφής του γονιδίου συμβολίζονται με κόκκινο χρώμα . Να προσδιοριστούν :
α)  η κωδική  και η μεταγραφόμενη αλυσίδα του γονιδίου , καθώς και ο προσανατολισμός τους ,
β)  το mRNA που προκύπτει από τη μεταγραφή του γονιδίου αυτού , με τον προσανατολισμό του ,
γ)  το πεπτίδιο που κωδικοποιεί το γονίδιο αυτό , με τον προσανατολισμό του ,
δ)  οι δεσμοί υδρογόνου του γονιδίου ,
ε)  να αιτιολογήσετε τις απαντήσεις σας .

ΑΣΚΣΗΣΗ ΜΕ ΕΚΦΡΑΣΗ ΑΣΥΝΕΧΟΥΣ ΓΟΝΙΔΙΟΥ ( ΠΟΙΟΤΙΚΗ)



Δίνεται το παρακάτω διακεκομμένο γονίδιο :
TTTTTGCTTAGGGCCCCCAAAAGTAGTGCATACATCGCGT
AAAAACGAATCCCGGGGGTTTT CATCACGTAT GTAGCGCA
Που κωδικοποιεί το πεπτίδιο :
H2N-met-tyr-phe-trp-gly-pro-COOH

 Να προσδιορίσετε :
α) Τον  προσανατολισμό των αλυσίδων του γονιδίου και να ορίσετε την κωδική αλυσίδα του
β) Το ώριμο και το πρόδρομο  mRNA , με τον προσανατολισμό τους
γ) Τα εσώνια του γονιδίου και του πρόδρομου mRNA
δ) Το πλήθος των μορίων νερού που απαιτούνται για την διαδικασία της ωρίμανσης που επιτελείται .
ε) Αν το λειτουργικό πεπτίδιο , για την υδρόλυσή του χρειάζεται την προσθήκη 3 μορίων νερού , να προσδιορίσετε την πιο πιθανή αλληλουχία των αμινοξέων του .
Αιτιολογείστε τις απαντήσεις σας .
Δίνεται ο γενετικός κώδικας .

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΕΚΦΡΑΣΗ ΑΣΥΝΕΧΟΥΣ ΓΟΝΙΔΙΟΥ(ΠΟΣΟΤΙΚΗ)



Ένα ασυνεχές γονίδιο περιέχει εσώνια σε ποσοστό 30% . Αν η 5΄  και η 3΄ αμετάφραστες περιοχές του mRNA  ,που παράγεται από  αυτό το γονίδιο , έχουν  μήκος 50 και 150 ριβονουκλεοτίδια αντίστοιχα και κατά την μετα-μεταφραστική τροποποίηση του πεπτιδίου  , που κωδικοποιείται από το γονίδιο αυτό , κόβονται 60 αμινοξέα , να υπολογιστούν :
α) Το μήκος του πρόδρομου mRNA
β) Το μήκος των εσωνίων  του γονιδίου και το μήκος των εσωνίων του πρόδρομου mRNA
γ) Το μήκος του ώριμου mRNA
δ) Ο αριθμός των αμινοξέων του πρόδρομου πεπτιδίου
ε) Οι πεπτιδικοί δεσμοί του λειτουργικού πεπτιδίου .