Δευτέρα 23 Απριλίου 2012

ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗΣ ΚΑΙ cDNA ΒΙΒΛΙΟΘΗΚΗΣ

ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ - cDNA



1.Είναι το σύνολο των βακτηριακών κλώνων που περιέχει το συνολικό DNA
του οργανισμού δότη .

Είναι το σύνολο των βακτηριακών κλώνων που περιέχει αντίγραφα των
mRNA των γονιδίων που εκφράζονται σ’ ένα κύτταρο .


2.Ο αριθμός των κλώνων είναι μεγάλος .
Ο αριθμός των κλώνων είναι μικρός .


3.Κάθε κλώνος περιέχει ένα κομμάτι(θραύσμα) από το γονιδίωμα του
οργανισμού δότη. Κάθε θραύσμα μπορεί να περιέχει είτε ολόκληρο γονίδιο
είτε τμήμα γονιδίου είτε περιοχές γονιδιώματος που δεν μεταγράφονται .

Κάθε κλώνος περιέχει ένα ολόκληρο γονίδιο ,αρκεί το γονίδιο αυτό να
εκφράζεται στο κύτταρο δότη .


4.Τα γονίδια της περιέχουν εσώνια και εξώνια (αν αναφερόμαστε σε
βιβλιοθήκη ευκαρυωτικού κυττάρου ) .

Τα γονίδιά της περιέχουν μόνο τα εξώνια .


5.Για την παρασκευή της ξεκινάμε από το DNA του κυττάρου δότη.
Για την παρασκευή της ξεκινάμε από το mRNA του κυτταροπλάσματος .


6.Για την παρασκευή της δεν απαιτείται αντίστροφη μεταγραφάση .
Για τη παρασκευή της απαιτείται αντίστροφη μεταγραφάση .


7.Χρησιμοποιείται όταν θέλουμε να έχουμε ολόκληρο το γονιδίωμα ενός
οργανισμού , προκειμένου να το μελετήσουμε π.χ. το γονιδίωμα ενός πολύ
επικίνδυνου παθογόνου μικροοργανισμού .

Χρησιμοποιείται όταν θέλουμε να παράγουμε μαζικά μια πρωτεΐνη .

Σάββατο 14 Απριλίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ - ΕΚΦΡΑΣΗ ΓΟΝΙΔΙΩΝ

Μια σύνθετη πρωτεΐνη αποτελείται από 4 πολυπεπτιδικές αλυσίδες , που
είναι ανά δύο όμοιες και η μεγαλύτερη πολυπεπτιδική αλυσίδα έχει 5
πεπτιδικούς δεσμούς περισσότερους από την μικρή .
Το πρόδρομο mRNA ,που είναι υπεύθυνο για τη σύνθεση του μικρού
πεπτιδίου , έχει μήκος 1500 βάσεις και το 1/3 αυτού του μήκους
είναι εξώνια . Από αυτά τα εξώνια , οι 5΄ και 3΄ αμετάφραστες
περιοχές έχουν συνολικό μήκος 47 βάσεις .Κατά τη μετα-μεταφραστική
τροποποίηση ,του μικρού πεπτιδίου , κόβονται 9 αμινοξέα , ενώ στο
μεγαλύτερο πεπτίδιο δεν κόβεται κανένα αμινοξύ , από το αρχικό αμινικό
άκρο του .Το ώριμο mRNA που είναι υπεύθυνο για το μεγαλύτερο πεπτίδιο
έχει 3΄και 5΄ αμετάφραστες περιοχές ,συνολικού μήκους 29 βάσεων και
το μήκος του αποτελεί το 25% του πρόδρομου mRNA .
Αν οι Δεσμοί Υδρογόνου στο γονίδιο που είναι υπεύθυνο για το
μεγαλύτερο πεπτίδιο της πρωτεΐνης είναι 4640 , να βρεθεί η σύσταση του
γονιδίου αυτού , σε αζωτούχες βάσεις .

Τρίτη 10 Απριλίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΒΙΟΣΥΣΣΩΡΕΥΣΗ

Από μετρήσεις βρέθηκε ότι σε 1 Kg μαρουλιού περιέχονται 2 mg , ενός μη βιοδιασπώμενου εντομοκτόνου . Να βρεθεί η συγκέντρωση του εντομοκτόνου αυτού , στο ανώτερο τροφικό επίπεδο , αν δίνεται ότι ισχύει η εξής τροφική αλυσίδα : Μαρούλι -> Κάμπια -> Κότσυφας -> Κουκουβάγια .

Δευτέρα 9 Απριλίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΑ ΜΟΝΤΕΛΑ

Μια καλλιεργήσιμη έκταση μπορεί να θρέψει 100.000 ανθρώπους ,αν αυτοί θεωρηθούν καταναλωτές 1ης τάξεως (φυτοφάγοι) . Πόσους ανθρώπους μπορεί να θρέψει η ίδια έκταση , αν αυτοί γίνουν καταναλωτές 2ης τάξεως (σαρκοφάγοι) ;