Τετάρτη 16 Μαΐου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΩΡΙΜΑΝΣΗ















Σε ένα ανθρώπινο κύτταρο παράγεται το παρακάτω πενταπεπτίδιο :
H2N- Met-Gly-Pro-Tyr-Ala-COOH
Το ασυνεχές γονίδιο που είναι υπεύθυνο για το συγκεκριμένο ολιγοπεπτίδιο βρίσκεται ανάμεσα στις περιοχές Α και Β και η αλληλουχία των βάσεών του είναι  :

Α
ACCGATATGGGCTTGCTCTACCATATACGGACGCATAACATGCAG 3΄
Β
TGGCTATACCCGAACGAGATGGTATATGCCTGCGTATTGTACGTC

Να βρεθούν :
α) η κωδική αλυσίδα του γονιδίου
β) σε ποια από τις δύο περιοχές εκατέρωθεν του γονιδίου βρίσκεται ο Υποκινητής ; Η άλλη περιοχή πως ονομάζεται και ποιος ο ρόλος της ;
γ) να γράψετε το ώριμο mRNA ,με τον προσανατολισμό του
δ) να γράψετε το πρόδρομο mRNA , με τον προσανατολισμό του
ε) να απεικονίσετε τα δύο εσώνια του γονιδίου
στ) πόσοι φωσφοδιεστερικοί δεσμοί σπάνε και πόσοι δημιουργούνται κατά τη διαδικασία της  ωρίμανσης ;
Να λάβετε υπόψη ότι δεν έγινε μετα-μεταφραστική τροποποίηση.
 Δίνονται επίσης οι τριπλέτες που κωδικοποιούν τα αντίστοιχα αμινοξέα :
AUG-met , GGA-gly , CCA-pro , UAU- tyr , GCA- ala

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΦΥΛΟΓΕΝΕΤΙΚΑ ΔΕΝΤΡΑ





















Δίνεται το παρακάτω φυλογενετικό δέντρο :
















Ποιοι οργανισμοί ανήκουν στην ίδια οικογένεια και ποιοι στην ίδια κλάση ;





ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΦΥΛΕΤΙΚΑ ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΑ



Το πυρηνικό DNA ενός  (φυσιολογικού) σωματικού κυττάρου  γυναίκας , στην αρχή της Μεσόφασης , έχει περίπου 108  περισσότερα ζεύγη βάσεων σε σχέση με το πυρηνικό DNA ενός (φυσιολογικού) σωματικού ανδρικού κυττάρου , το οποίο βρίσκεται στην ίδια φάση του κυτταρικού κύκλου και έχει συνολικό μήκος 6.109  ζεύγη βάσεων .
Α) Είναι δικαιολογημένη αυτή η διαφορά ; Αν ναι γιατί ;
Β) Να υπολογίσετε το μήκος του πυρηνικού DNA σε ένα ωάριο της γυναίκας αυτής καθώς και το αντίστοιχο μήκος στα σπερματοζωάρια  του άντρα .

Δευτέρα 23 Απριλίου 2012

ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗΣ ΚΑΙ cDNA ΒΙΒΛΙΟΘΗΚΗΣ

ΓΟΝΙΔΙΩΜΑΤΙΚΗ - cDNA



1.Είναι το σύνολο των βακτηριακών κλώνων που περιέχει το συνολικό DNA
του οργανισμού δότη .

Είναι το σύνολο των βακτηριακών κλώνων που περιέχει αντίγραφα των
mRNA των γονιδίων που εκφράζονται σ’ ένα κύτταρο .


2.Ο αριθμός των κλώνων είναι μεγάλος .
Ο αριθμός των κλώνων είναι μικρός .


3.Κάθε κλώνος περιέχει ένα κομμάτι(θραύσμα) από το γονιδίωμα του
οργανισμού δότη. Κάθε θραύσμα μπορεί να περιέχει είτε ολόκληρο γονίδιο
είτε τμήμα γονιδίου είτε περιοχές γονιδιώματος που δεν μεταγράφονται .

Κάθε κλώνος περιέχει ένα ολόκληρο γονίδιο ,αρκεί το γονίδιο αυτό να
εκφράζεται στο κύτταρο δότη .


4.Τα γονίδια της περιέχουν εσώνια και εξώνια (αν αναφερόμαστε σε
βιβλιοθήκη ευκαρυωτικού κυττάρου ) .

Τα γονίδιά της περιέχουν μόνο τα εξώνια .


5.Για την παρασκευή της ξεκινάμε από το DNA του κυττάρου δότη.
Για την παρασκευή της ξεκινάμε από το mRNA του κυτταροπλάσματος .


6.Για την παρασκευή της δεν απαιτείται αντίστροφη μεταγραφάση .
Για τη παρασκευή της απαιτείται αντίστροφη μεταγραφάση .


7.Χρησιμοποιείται όταν θέλουμε να έχουμε ολόκληρο το γονιδίωμα ενός
οργανισμού , προκειμένου να το μελετήσουμε π.χ. το γονιδίωμα ενός πολύ
επικίνδυνου παθογόνου μικροοργανισμού .

Χρησιμοποιείται όταν θέλουμε να παράγουμε μαζικά μια πρωτεΐνη .

Σάββατο 14 Απριλίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ - ΕΚΦΡΑΣΗ ΓΟΝΙΔΙΩΝ

Μια σύνθετη πρωτεΐνη αποτελείται από 4 πολυπεπτιδικές αλυσίδες , που
είναι ανά δύο όμοιες και η μεγαλύτερη πολυπεπτιδική αλυσίδα έχει 5
πεπτιδικούς δεσμούς περισσότερους από την μικρή .
Το πρόδρομο mRNA ,που είναι υπεύθυνο για τη σύνθεση του μικρού
πεπτιδίου , έχει μήκος 1500 βάσεις και το 1/3 αυτού του μήκους
είναι εξώνια . Από αυτά τα εξώνια , οι 5΄ και 3΄ αμετάφραστες
περιοχές έχουν συνολικό μήκος 47 βάσεις .Κατά τη μετα-μεταφραστική
τροποποίηση ,του μικρού πεπτιδίου , κόβονται 9 αμινοξέα , ενώ στο
μεγαλύτερο πεπτίδιο δεν κόβεται κανένα αμινοξύ , από το αρχικό αμινικό
άκρο του .Το ώριμο mRNA που είναι υπεύθυνο για το μεγαλύτερο πεπτίδιο
έχει 3΄και 5΄ αμετάφραστες περιοχές ,συνολικού μήκους 29 βάσεων και
το μήκος του αποτελεί το 25% του πρόδρομου mRNA .
Αν οι Δεσμοί Υδρογόνου στο γονίδιο που είναι υπεύθυνο για το
μεγαλύτερο πεπτίδιο της πρωτεΐνης είναι 4640 , να βρεθεί η σύσταση του
γονιδίου αυτού , σε αζωτούχες βάσεις .

Τρίτη 10 Απριλίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΒΙΟΣΥΣΣΩΡΕΥΣΗ

Από μετρήσεις βρέθηκε ότι σε 1 Kg μαρουλιού περιέχονται 2 mg , ενός μη βιοδιασπώμενου εντομοκτόνου . Να βρεθεί η συγκέντρωση του εντομοκτόνου αυτού , στο ανώτερο τροφικό επίπεδο , αν δίνεται ότι ισχύει η εξής τροφική αλυσίδα : Μαρούλι -> Κάμπια -> Κότσυφας -> Κουκουβάγια .

Δευτέρα 9 Απριλίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΔΙΑΤΡΟΦΙΚΑ ΜΟΝΤΕΛΑ

Μια καλλιεργήσιμη έκταση μπορεί να θρέψει 100.000 ανθρώπους ,αν αυτοί θεωρηθούν καταναλωτές 1ης τάξεως (φυτοφάγοι) . Πόσους ανθρώπους μπορεί να θρέψει η ίδια έκταση , αν αυτοί γίνουν καταναλωτές 2ης τάξεως (σαρκοφάγοι) ;

Κυριακή 11 Μαρτίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΔΙΫΒΡΙΔΙΣΜΟΥ

Διασταυρώνουμε αρσενικά έντομα με κοκκινόασπρες πτέρυγες και μακριές
σμήριγγες με θηλυκά που έχουν άσπρες πτέρυγες και μακριές σμήριγγες
και προκύπτουν 328 άτομα με τους εξής φαινότυπους :

64 αρσενικά με μακριές σμήριγγες και άσπρες πτέρυγες
63θηλυκά με μακριές σμήριγγες και άσπρες πτέρυγες
62 αρσενικά με μακριές σμήριγγες και κοκκινόασπρες πτέρυγες
56 θηλυκά με μακριές σμήριγγες και κόκκινες πτέρυγες
20 αρσενικά με κοντές σμήριγγες και κοκκινόασπρες πτέρυγες
22θηλυκά με κοντές σμήριγγες και άσπρες πτέρυγες
21 θηλυκά με κοντές σμήριγγες και κόκκινες πτέρυγες
20 αρσενικά με κοντές σμήριγγες και άσπρες πτέρυγες

Να βρείτε :
α) τον τρόπο που κληρονομείται το κάθε γνώρισμα
β) τους γονότυπους των ατόμων της P γενιάς
γ) να γίνει η διασταύρωση διϋβριδισμού και να υπολογιστεί η φαινοτυπική αναλογία .

Δίνεται ότι ο μηχανισμός καθορισμού του φύλου σε κάποιους οργανισμούς
, δεν είναι ο ίδιος με αυτόν του ανθρώπου .

Τετάρτη 7 Μαρτίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ(ΠΟΣΟΤΗΤΑ ΓΕΝΕΤΙΚΟΥ ΥΛΙΚΟΥ ΑΝΑΛΟΓΑ ΜΕ ΤΙΣ ΦΑΣΕΙΣ ΤΟΥ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΥ ΚΥΚΛΟΥ)




















O γαμέτης της Drosophila melanogaster (μύγα των φρούτων ή μύγα ξυδιού)
έχει 4 χρωμοσώματα με συνολικό μήκος DNA 1.6*108 (10 εις την ογδόη) ζεύγη αζωτούχων
βάσεων. Να υπολογίσετε τον αριθμό των χρωμοσωμάτων και το συνολικό
μήκος DNA σε :

1) κύτταρο της που βρίσκεται στο στάδιο G1 της Μεσόφασης ( αρχή
Μεσόφασης ) .
2) σωματικό κύτταρό της που βρίσκεται στο στάδιο της Μετάφασης της
Μίτωσης .
3) γενετικό κύτταρό της στο στάδιο της Μετάφασης Ι της Μείωσης Ι .
4) γενετικό κύτταρό της στο στάδιο της Μετάφασης ΙΙ της Μείωσης ΙΙ .

Κυριακή 4 Μαρτίου 2012

ΟΙΚΟΣΥΣΤΗΜΑΤΑ-ΜΕΓΑΔΙΑΠΛΑΣΕΙΣ (BIOMES)

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΧΡΩΜΟΣΩΜΙΚΕΣ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ

Άντρας φυσιολογικός παντρεύεται μία γυναίκα φορέα της

αιμορροφιλίας Α. Από τη διασταύρωση αυτή προκύπτει παιδί με

τρία Χ φυλετικά χρωμοσώματα (τρισωμία) και με αιμορροφιλία Α .

Αν η γονιδιακή μετάλλαξη αποκλείεται και στους δύο γονείς , να

δώσετε μια πιθανή εξήγηση για το πως προέκυψε το παιδί αυτό .

Σάββατο 3 Μαρτίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΕΚΦΡΑΣΗΣ ΓΟΝΙΔΙΟΥ (ΠΟΙΟΤΙΚΗ)

Δίνεται το παρακάτω γονίδιο ενός προκαρυωτικού κυττάρου καθώς και η διεύθυνση της μεταγραφής του .

5΄AATACAATATGCTAGGAATTGCGGTGATACATGTATGAAT 3΄
3΄TTAT GTT ATACGATCCTTAACGCCACTATGTACATACTTA 5΄

3΄ < ---------------- 5΄

Με την χρήση του γενετικού κώδικα του σχολικού βιβλίου (σελ.35) να βρείτε το πεπτίδιο που κωδικοποιείται από το παραπάνω γονίδιο και να σημειώσετε και τον προσανατολισμό του .

Παρασκευή 2 Μαρτίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ -ΕΚΦΡΑΣΗ ΓΟΝΙΔΙΟΥ(ΠΟΣΟΤΙΚΗ)

Ένα ασυνεχές γονίδιο έχει μήκος 10.000 ζεύγη αζωτούχων βάσεων και τα εσώνια του καλύπτουν το 30% του μήκους του . Αν οι 5΄ και 3΄ αμετάφραστες περιοχές του mRΝA , κατέχουν συνολικά μήκος 300 βάσεις , να υπολογίσετε τον αριθμό των αμινοξέων της λειτουργικής πεπτιδικής αλυσίδας , που παράγεται με την έκφραση του παραπάνω γονιδίου. Δίνεται ότι κατά τη μετα-μεταφραστική τροποποίηση της πεπτιδικής αλυσίδας κόβονται 9 αμινοξέα ,από το αρχικό αμινικό άκρο της .

Πέμπτη 1 Μαρτίου 2012

ΑΣΚΗΣΗ ΜΕ ΤΟ 10%

Σε ένα οικοσύστημα υπάρχουν 4 τροφικά επίπεδα .Στα 3 τροφικά επίπεδα των καταναλωτών η συνολική ενέργεια που είναι διαθέσιμη είναι 55.500 kj . Να υπολογιστεί η ενέργεια που είναι διαθέσιμη στο τροφικό επίπεδο των παραγωγών και να γίνει η τροφική πυραμίδα ενέργειας .